En attendant l’élaboration d’un organigramme officiel validé à l’échelle national l’USMBA a élaboré une organisation fonctionnelle des services, que ce sois a la présidence ou dans les établissements.
Cette organisation intègre dans tous les cas les départements et services cadrant les affaires académiques et la formation, la recherche scientifique, l’innovation et la coopération, les affaires administratives et les services chargés de la vie estudiantines par exemple.